橋核酸研究平臺
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什么是橋核酸(BNA)?
自然核酸在其化學結構中具有更高的自由度。這一特性對DNA-DNA和RNA-RNA雙鏈形成(雜交)熱力學上是不利的,并經常受到內、外核酸酶的降解。但對于高度敏感的基因定位應用來說,提高結合親和力(雜交能力)仍是一個未解決的問題。
Bridged nucleic acid 2',4'-BNANC (2'-O,4'-aminoethylene bridged nucleic acid) 是一種含有N-O聯接的六元環結構的化合物。這種新型核酸類似物可以被合成并嵌入到寡核苷酸中。與之前幾代的限制性核酸(PNA & LNA)相比,BNA寡核苷酸對其互補鏈表現出明顯更高的親和力。其對核酸酶抵抗活性的超常水平的敏感性和特異性使BNA成為開發高價值檢測系統和治療產品的優越工具。
BNA寡核苷酸允許在引物和探針的設計中具有更大的靈活性。它們可以與DNA、RNA和其他核酸類似物混合,使用標準的磷酰胺合成化學。BNA寡核苷酸也可以很容易地用標準的寡核苷酸標簽如DIG、熒光染料、生物素、氨鏈接劑等進行標記或修飾。
特點
BNA被發現具有以下特性
對互補的RNA或DNA具有更高的結合親和力
優異的單堿基錯配識別能力
增強的對互補RNA的選擇性結合能力
更強且更具序列選擇性的三鏈形成特性
對內切核酸酶和外切核酸酶具有更強的抗性,甚至比磷代硫酸酯類似物更高
BNA的發展
與其他核酸類似物的比較
診斷和研究應用
DNA研究
mRNA研究
? 實時/定量PCR
? 原位雜交(ISH)
? Northern印跡
? 基于磁珠的應用
? 熒光激活細胞分選隔離
? RNA功能抑制
? 微陣列分析
? RNA修飾
? DNA酶
miRNA研究
? 實時/定量PCR
? 原位雜交(ISH)
? 微陣列分析
? Northern印跡
? 基于磁珠的應用
? RNA功能抑制
? RNA修飾
? 功能分析
ncRNA研究
? 實時/定量PCR
? 原位雜交(ISH)
? 熒光激活細胞分選
? 微陣列分析
? Northern印跡
? RNA功能抑制
? RNA修飾
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